Rhinogen® Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)具(jù)有(yǒu)穩定性高、比活性高等特點,是兩種高度純化和非常穩定的糖苷酶的組合,适用(yòng)于蛋白質(zhì)組學(xué)及糖生物(wù)學(xué)研究中(zhōng)糖蛋白上常見O-連聚糖的有(yǒu)效釋放。
高純度:沒有(yǒu)污染蛋白酶/其它糖苷酶,純度≥95%;
高穩定性:每批Kit試劑盒中(zhōng)酶及試劑都經過嚴格的質(zhì)量控制,以實現高穩定性;
高比活性:有(yǒu)效釋放糖蛋白上唾液酸修飾O-連聚糖;
HPLC、MS兼容:試劑盒中(zhōng)所有(yǒu)的酶及試劑與下遊HPLC及MS兼容。
背景:
Rhinogen® Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)包含O-Glycosidase及α2-3,6,8,9 Neuraminidase,二者均是重要的糖基化研究的工(gōng)具(jù)酶,組合用(yòng)于糖蛋白O-連糖鏈的酶切釋放。Rhinogen® O-Glycosidase能(néng)夠将糖蛋白中(zhōng)Ser或Thr殘基的羟基連接的Core 1(Gal-β(1-3)-GalNAc-)及Core 3(GlcNAc-β(1-3)-GalNAc-)O-連雙糖釋放下來,如圖1。核心結構的任何修飾都可(kě)以阻斷O-Glycosidase的作(zuò)用(yòng),最常見的修飾是核心結構的單、二或三唾液酸化。Rhinogen® α2-3,6,8,9 Neuraminidase能(néng)夠釋放O-連糖鏈非還原末端α (2,3)-, α (2,6)-, α (2,8)-, α (2,9)-唾液酸殘基,如圖2,不同唾液酸殘基的釋放速率大緻為(wèi)α (2,6)->α (2,3)- >α (2,8)- >α (2,9)-。唾液酸酶的這種組合模式使得O-連糖鏈的酶切釋放更徹底。該Kit包含的所有(yǒu)酶及試劑均與下遊HPLC及MS兼容。
圖1. O-Glycosidase與α2-3,6,8,9 Neuraminidase組合用(yòng)于糖蛋白O-連糖鏈的酶切釋放
圖2. Rhinogen® α2-3,6,8,9 Neuraminidase作(zuò)用(yòng)位點
包裝(zhuāng)規格:
Rhinogen® Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)包裝(zhuāng)規格如下:
O-Glycosidase
α2-3,6,8,9Neuraminidase
1,200,000U
0.6U
30μl
30μl
目錄号
組成
規格
體(tǐ)積
QPF-008
配套試劑:
Rhinogen® Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)提供的配套試劑如下:
試劑
成分(fēn)
10×Denaturing緩沖液
5%SDS,0.4M DTT
10×Glyco緩沖液2
0.5MSodium Phosphate(pH7.5 at 25°C)
10%NP-40溶液
10%NP-40
産(chǎn)品來源:
本試劑盒中(zhōng)的所有(yǒu)酶都是大腸杆菌BL21中(zhōng)表達并分(fēn)離純化的重組酶:O-Glycosidase基因來源于Enterococcus Faecalis,分(fēn)子量為(wèi)147kDa;α2-3,6,8,9 Neuraminidase基因來源于Arthrobacter ureafaciens,分(fēn)子量為(wèi)66KDa。
産(chǎn)品質(zhì)量:
SDS-PAGE分(fēn)析,純度≥95%;沒有(yǒu)檢測到污染的糖苷外切酶、糖苷内切酶及蛋白酶活性。
酶活定義:
1個O-Glycosidase酶活力單位定義:在100 μl反應體(tǐ)系中(zhōng),37°C,pH7.5條件下,1小(xiǎo)時内從5mg唾液酸酶消化後的非變性fetuin 上催化釋放0.68nmol O-連二糖所需要的酶量。1U Rhinogen® O-Glycosidase =1 unit NEB O-Glycosidase。
1個α2-3,6,8,9 Neuraminidase酶活力單位定義:在37°C,pH5.5條件下,以對硝基苯基-α-D-N-乙酰神經氨酸為(wèi)底物(wù),1分(fēn)鍾内催化釋放1 μmol 對硝基苯酚所需要的酶量。1U Rhinogen® α2-3,6,8,9 Neuraminidase =1 U Prozyme Glyko® Sialidase ATM。
儲存條件:
-20°C。
産(chǎn)品特點:
Rhinogen® Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)具(jù)有(yǒu)穩定性高、比活性高等特點,是兩種高度純化和非常穩定的糖苷酶的組合,适用(yòng)于蛋白質(zhì)組學(xué)及糖生物(wù)學(xué)研究中(zhōng)糖蛋白上常見O-連聚糖的有(yǒu)效釋放。
1. 高純度:沒有(yǒu)污染蛋白酶/其它糖苷酶,純度≥95%;
2. 高穩定性:每批Kit試劑盒中(zhōng)酶及試劑都經過嚴格的質(zhì)量控制,以實現高穩定性;
3. 高比活性:有(yǒu)效釋放糖蛋白上唾液酸修飾O-連聚糖;
4. HPLC、MS兼容:試劑盒中(zhōng)所有(yǒu)的酶及試劑與下遊HPLC及MS兼容。
應用(yòng):
1. 聚糖結構分(fēn)析;
2. 結合位點及功能(néng)分(fēn)析;
3. 治療性糖蛋白的表征及質(zhì)量控制;
4. 蛋白質(zhì)組學(xué)分(fēn)析,消除糖蛋白的異質(zhì)性。
使用(yòng)建議:
變性條件下去糖基化方案:
1. 取10-100µg糖蛋白溶液,加入1µl 10×Denaturing緩沖液,補加純化水使得反應體(tǐ)系為(wèi)10µl;
2. 将上述10µl體(tǐ)系100℃處理(lǐ)10min,使糖蛋白完全變性;
3. 室溫冷卻5min;
4. 在上述變性體(tǐ)系中(zhōng),分(fēn)别加入2µl 10×Glyco緩沖液2、2µl 10% NP-40溶液、1-4μl O-Glycosidase、1-2μl α2-3.6.8.9Neuraminidase,補加純化水至反應總體(tǐ)積為(wèi)50μl,輕柔混勻;
5. 37°C 條件下反應1-5hr;
注意:對于不同的糖蛋白樣品,需要實驗摸索最适的酶濃度及反應時間。
非變性條件下去糖基化方案:
1. 取10-100µg糖蛋白底物(wù)溶液,加入2µl 10×Glyco緩沖液2、純化水及1-4μl O-Glycosidase、1-2μl α2-3.6.8.9Neuraminidase,使得總反應體(tǐ)積為(wèi)20µl,輕柔混勻;
2. 37°C 條件下反應1-4hr。
注意:通常情況下,糖蛋白變性與否不顯著影響O-連糖鏈去除的效率,但也不排除個例,建議根據自己的底物(wù)特性,選擇合适的方法。
當對天然糖蛋白去糖基化時,建議将等量糖蛋白樣品進行變性後再同步進行酶切作(zuò)為(wèi)陽性對照,以确定非變性條件下去糖基化反應的程度。
操作(zuò)說明:
1. 上述操作(zuò)方法旨在為(wèi)Rhinogen® Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)作(zuò)為(wèi)去糖基化試劑操作(zuò)的一般指南,對于不同的糖蛋白樣品,去糖基化活性高度依賴于反應條件,建議進行适當優化或根據經驗确定最優的操作(zuò)方法;
2. 去糖基化體(tǐ)系可(kě)以線(xiàn)性放大或縮小(xiǎo);
3. 由于變性緩沖液中(zhōng)含有(yǒu)SDS,而SDS會抑制Rhinogen® O-Glycosidase的活性,因此在變性糖蛋白反應體(tǐ)系中(zhōng)需加入終濃度為(wèi)1%的NP-40,其能(néng)有(yǒu)效解除SDS對O-Glycosidase酶活的抑制;
4. 本産(chǎn)品适用(yòng)于天然或者變性糖蛋白,對于天然糖蛋白的去糖基化,可(kě)能(néng)需要更多(duō)的酶及更長(cháng)的反應時間;
5. EDTA、對氯丙基苯磺酸、Mn2+、Zn2+對O-Glycosidase的酶活有(yǒu)一定的抑制作(zuò)用(yòng),1mM各物(wù)質(zhì)存在條件下,酶活回收率分(fēn)别為(wèi)63%、60%、44%、66%%;
6. 本産(chǎn)品僅供研究使用(yòng),不适用(yòng)于人或動的物(wù)診斷及治療用(yòng)途。
此試劑盒與下遊HPLC及MS兼容嗎?
是的,Rhinogen® Protein Deglycosylation Kit Ⅰ (for O-linked Glycans )所有(yǒu)的酶及緩沖試劑均與下遊HPLC及MS應用(yòng)兼容。可(kě)以采用(yòng)微透析或微量過濾制備HPLC及MS分(fēn)析的蛋白。